Biotecnología
Integrantes
Dr. Juan Cedano Rodríguez – Profesor Agregado (Grado 4, 40 h)
Mail: jcedano@unorte.edu.uy
Msc. Gabriela Ferragut – Profesor Asistente (Grado 3, 40 h, DT)
Mail: gferragu@fq.edu.uy
Msc. María Angélica Severi – Profesor Asistente (Grado 3, 40 h)
Mail: angelicaseveri@gmail.com
Msc. Alejandra Calvo – Profesor Asistente (Grado 3, 33 h)
Mail: gcalvo@fq.edu.uy
Líneas de investigación
Título: Biofísica de estructura de proteínas
Objetivo: En esta línea se trabaja en modelizar con el mínimo número de parámetros el comportamiento de las proteínas a la hora de plegarse y formar complejos, usando sus propiedades físicas considerando la estructura global de la proteína.
Título: Diseño de vacunas
Objetivo: Esta línea investiga diversos aspectos del diseño de vacunas entre ellos los métodos usados para identificar las características más relevantes de las proteínas implicadas en la patogenicidad o la identificación de los péptidos que podrían causar reacciones adversas si se incluyen en las vacunas.
Título: Extracción de patrones de comportamiento de datos de microarrays
Objetivo: Esta línea usa las microarrays depositadas en las bases de datos públicas para extraer conocimiento relevante. Desde la extracción de patrones ocultos de expresión entre los genes, permitiendo tener una idea clara unos genes se relacionaban con otros mediante su patrón de expresión, a cruzar datos con otras bases de datos de función de proteínas o de referencias bibliográficas. Pero quizás lo más relevante es que permite tener una idea del complejo funcionamiento de las células humanas independientemente de su procedencia (colon, piel, hueso...), ya que extraer los comportamientos básicos más comunes. Por ejemplo ante condiciones de fuerte estrés el tejido puede crecer (colon o corion) o ulcerarse (epidermis o hueso), y estos comportamientos alternativos son identificados por el sistema y permite conocer los genes implicados, así como entender mejor el proceso, o proponer vías terapéuticas.
Título: Identificación de proteínas Moonlighting (multifuncionales)
Objetivo: El objetivo de esta línea es adentrarse en uno de los problemas de la biología molecular después del proyecto genoma humano. ¿Por qué con sólo 20.000 genes los humanos pueden realizar todas sus funciones cuando originalmente se pensó que se necesitarían al menos 100.000? Una de los posibles explicaciones son las proteínas multifuncionales, existen proteínas que realizan hasta 13 funciones distintas. Esta propiedad de las proteínas parece más común de lo que se esperaba y tiene implicaciones en patologías, diseño de vacunas y evolución.
Título: Búsqueda de sustancias bioactivas en especies nativas.
Objetivo: En esta línea se colabora con distintos grupos de Cenur, el INIA Salto grande y Facultad de química.
Título: Suite para la identificación automáticas de patrones MHC II
Objetivo: Se trata de un servidor que automáticamente descarga le las librerías de péptidos su afinidad de unión a distintos MHC de tipo II. A partir de estos péptidos, entre los que hay muchos identificados erróneamente, es capaz de forma no supervisada filtrar de ruido las librerías, construir nuevos patrones y ponerlos a la disposición de la comunidad científica.
Título: Biotecnología contra el cáncer
Objetivo: En esta línea de trabajo colaboramos con otros grupos en diseñar vehículos proteicos en terapia contra el cáncer. También tememos un proyecto desarrollado localmente en el que mediante ingeniería de proteína usar varios dominios de la proteína humana Nidogeno1, para usarla de marcador de los contornos de los tumores y reducir la afectación de los tejidos después de la resección tumoral, gracias a que en esta proteína se podría incorporar actividad flurescente en uno de sus dominios mediante mutagénesis dirigida, y es una proteína con alta afinidad por proteínas de la matriz celular entre ellas el colágeno IV y le perlecan, expresado en altas concentraciones en los límites entre tumor y tejido sano.